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国际首例一串红基因图谱发布

http://www.tycflbgfw51.com 2018-07-05 来历:花卉报 作者:薛倩 宣布谈论(0)

  日前,由北京市博狗娱乐科学院和北京林业大学科研人员完结的《重要欣赏植物一串红的高质量参阅基因组拼装》论文,在牛津大学出版社的威望刊物《大数据科学》(Gigascience)在线宣布。这是一串红基因图谱国际首发,对唇形科植物的研讨、育种具有重要含义。

  “这个基因图谱便是一张地图,没有这张地图之前,许多作业都是靠经历探索,有了这张地图,就能够有意图、更明确地去做。”北京市博狗娱乐科学院高级工程师、论文一起的榜首作者辛海波博士这样解说一串红基因图谱的含义。例如,曾经做一串红的杂交育种靠实践堆集经历,现在则能够经过基因图谱找到花样、抗性、生长发育等方面的操控基因,直接有意图地进行杂交,或运用基因修改技能,“规划”出符合要求的植株特性。

  “人类基因图谱的发布,为精准医疗供给了或许,一串红的基因图谱也会为快速种质立异和基础研讨翻开了一扇大门,并且就像一个人的基因图谱能够全人类共用相同,一串红的基因图谱关于整个唇形科适用。”北京林业大学林木分子规划育种高精尖立异中心副教授、本论文通讯作者毛建丰说。

  唇形科是开花植物中的第六大科,包含约236个属、6900个至7200个种类,其间许多种类含有丰厚的芳香和药用成分,得到广泛重视。如芳香植物百里香、罗勒、迷迭香,药用植物丹参、黄芩、荆芥、藿香、紫苏,兼具芳香和药用的薄荷,兼具芳香和欣赏用处的薰衣草等。这次对一串红700多万个基因序列做了高质量排序,关于检查种间分解前史、了解次生代谢通路解析等有严重效果,对唇形科芳香和药用成分构成机制和深化开发作业也有重要的参阅价值。

  据了解,一串红基因研讨项目选择国旗赤色‘奥运圣火’的2个单株进行了分子测序(PacBio Single-Molecule Real-Time,SMRT),取得了808M的一串红高质量全基因组序列。以contigs和scaffolds(2个基因组序列片段)长度散布为点评方针,一串红和已报导的薄荷,以及2个丹参基因组进行了比较,结果表明,本次研讨中取得的一串红基因组质量远高于其他2类唇形科植物。毛建丰介绍说,本次能取得高质量的基因图谱,要害之一是选种,‘奥运圣火’是一个自交种类,它的两套基因序列一起,提高了基因组合摆放的准确性,而这其间园科院在一串红范畴30多年的研讨经历非常重要,‘奥运圣火’自身也是园科院的自育种类。

  一串红曾广泛运用于花坛、景象,但近年来运用有下滑趋势,此次基因图谱的发布,有助于一串红的快速育种,或将翻开一串红运用的“第二春”。在其他唇形科花卉方面,运用一串红的基因谱图,除了研讨花样和抗性相关基因,还能够发现药用、精油等有效成分的组成调控机制,对培养多用处的唇形科新种类供给了新的或许。

  本项目自2016年11月开端,本年6月19日论文正式在线上发布。北京市博狗娱乐科学研讨院教授级高工董爱香博士、高级工程师辛海波博士、高级工程师李子敬博士为论文的一起榜首作者,北京市博狗娱乐科学研讨院副院长、美化植物育种北京市要点试验室主任、教授级高工丛日晨博士和北京林业大学林木分子规划育种高精尖立异中心副教授毛建丰为本论文的一起通讯作者。

国际首例一串红基因图谱发布

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修改:崔京荣
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